在普濟寺前有一個建於明朝、面積約為15畝的蓮花池，名為「海印池」或「放生池」。池上建有三座橋，中間的一座橋北接普濟寺正門，南接御碑亭。御碑亭中有雍正皇帝書寫的御碑一方，記載了普陀山的歷史。海印池旁還立有元朝時修建的「多寶塔」，高32米，共六層。上面三層塔身，每面都刻有一尊呈跏趺坐式的佛像，十分生動。

普濟寺山門也很有特點。它是一個石牌坊，四柱三門，高約20米。坊內北側樹著一個石牌，上書「文武官員軍民人等到此下馬」，以表達對觀音菩薩的尊敬。山門東側是鐘樓，西側有鼓樓。每天清晨撞鐘，傍晚擊鼓，即「晨鐘暮鼓」。

進入山門，首先來到的是天王殿。大殿面寬五間，進深四間，重簷歇山頂。殿中供奉的是光首、笑臉、袒胸、盤膝、一手拿一支布袋的彌勒佛。天王殿後是八株茂盛的香樟樹。

普濟寺的主殿是大圓通殿，供奉的是觀音菩薩。「圓通」是觀音菩薩的別號。殿面寬七間，進深六間，重簷歇山頂，黃琉璃頂，九踩斗拱，十分雄偉莊嚴。大殿正中端坐著高達8.8米的觀音菩薩像，她通體呈金黃色，臉上透露出的是慈祥、安寧的笑容。在其像兩側，分別站立著善財和龍女；東西兩壁則矗立著16尊不同服飾、不同形態的菩薩，稱「觀音三十二應身」，即觀音以不同身份教化世人時的現身說法形象。這種雕塑方法是觀音道場的獨特之處。

普濟寺後灣還有真歇庵遺址，是開山祖師真歇和尚修行之處。此外，普濟寺後的「慈雲石」狀如寶鳥，也是世間罕見。